對傳染病必須在早期就能作出正確的診斷，正確診斷是及時隔離和采取有效治療的基礎(chǔ)，從而防止其擴散。特別是鼠疫，霍亂等烈性傳染病以及我國尚無但可能傳入的愛滋病，對首例的診斷具有重要意義。其診斷方法與步驟是：

（一）臨床特點

包括詳詢病史及體格檢查的發(fā)現(xiàn)加以綜合分析。依其潛伏期長短，起病的緩急，發(fā)熱特點、皮疹特點、中毒癥狀、特殊癥狀及體征可作出初步診斷。如猩紅熱的紅斑疹，麻疹的口腔粘膜斑，百日咳的痙攣性咳嗽，白喉的假膜，流行性腦脊髓膜炎的皮膚瘀斑，傷寒的玫瑰疹，脊髓灰質(zhì)炎的肢體弛緩性癱瘓、流行性出血熱的三紅及球結(jié)膜滲出等。

（二）流行病學(xué)資料

包括發(fā)病地區(qū)、發(fā)病季節(jié)、既往傳染病情況、接觸史、預(yù)防接種史；還包括年齡、藉貫、職業(yè)、流行地區(qū)旅居史等，結(jié)合臨床資料的歸納分析，有助于臨床診斷。

（三）實驗室檢查

1.三大常規(guī)檢查

（1）血液常規(guī)大部分細菌性傳染病白細胞總數(shù)及中性粒細胞增多，唯傷寒減少，布魯氏菌病減少或正常。絕大多數(shù)病毒性傳染病白細胞部數(shù)減少且淋巴細胞比例增高，但流行性出血熱、流行性乙型腦炎總數(shù)增高。血中出現(xiàn)異型淋巴細胞，見于流行性出血熱。傳染性單核細胞增多癥。原蟲病白細胞總數(shù)偏低或正常。

（2）尿常規(guī)、流行性出血熱、鉤端螺旋體病患者尿內(nèi)有蛋白、白細胞、紅細胞、且前者尿內(nèi)有膜狀物。黃疸型肝炎尿膽紅質(zhì)陽性。

（3）糞常規(guī) 菌痢、腸阿米巴病，呈粘膿血便和果漿樣便；細菌性腸道感染多呈水樣便或血水樣便或混有膿及粘液。病毒性腸道感染多為水樣便或混有粘液。

2.病原體檢查（1）直接檢查 腦膜炎雙球菌、瘧原蟲、微絲蚴、溶組織阿米巴原蟲及包囊，血吸蟲卵，螺旋體等病原體可在鏡下查到及時確定診斷。

（2）病原體分離 依不同疾病取血液、尿、糞、腦脊液、骨髓、鼻咽分泌物、滲出液，活檢組織等進行培養(yǎng)與分離鑒定。細菌能在普通培養(yǎng)基或特殊培養(yǎng)基內(nèi)生長，病毒及立克次體必須在活組織細胞內(nèi)增殖，培養(yǎng)時根據(jù)不同的病原體，選擇不同的組織與培養(yǎng)基或動物接種。

3.免疫學(xué)檢查

免疫學(xué)檢查是一種特異性的診斷方法，廣泛用于臨床檢查，以確定診斷和流行病學(xué)調(diào)查。血清學(xué)檢查可用已知抗原檢查未知抗體，也可用已知抗體檢查未知抗原。抗體檢查抗原的稱反向試驗，抗原抗體直接結(jié)合的稱直接反應(yīng)，抗原和抗體利用載體后相結(jié)合的稱間接反應(yīng)。測定血清中的特異性抗體需檢查雙份血清，恢復(fù)期抗體滴度需超過病初滴度4倍才有診斷意義。免疫學(xué)檢查包括：

（1）特異抗體檢測：①直接凝集試驗；②間接凝集試驗；③沉淀試驗；④補體結(jié)合試驗；⑤中和試驗；⑥免疫熒光檢查；⑦放射免疫測定，⑧酶聯(lián)免疫吸附試驗；（2）細胞免疫功能檢查常用的有皮膚試驗，E玫瑰花形成試驗，淋巴細胞轉(zhuǎn)化試驗，血液淋巴細胞計數(shù)，T淋巴細胞計數(shù)及用單克隆抗體檢測T細胞亞群以了解各亞群T細胞數(shù)和比例。

4.分子生物學(xué)檢測

利用同位素32P或生物素標記的分子探針可以檢出特異性的病毒核酸。近年發(fā)展起來的聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)（polymerase chain reaction， PCR）是利用人工合成的核苷酸序列作為“引物”，在耐熱DNA聚合酶的作用下，通過變化反應(yīng)溫度，擴增目的基因，用于檢測體液，組織中相應(yīng)核酸的存在，在擴增循環(huán)中DNA片段上百萬倍增加是很特異和非常靈敏的方法。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的進步發(fā)展，可以設(shè)想分子生物學(xué)技術(shù)在傳染病診斷方面有著光輝的前景。

5.其它有氣相色譜、鱟試驗、診斷性穿刺、乙狀結(jié)腸鏡檢查、活體組織檢查、生物化學(xué)檢查、X線檢查、超聲波檢查、同位素掃描檢查、電子計算機體層掃描（CT）等檢查。