純化抗原的鑒定方法較多，常用的有聚丙烯酰胺凝膠電泳法、結(jié)晶法、免疫電泳法、免疫雙擴(kuò)散法等。事實上，僅用一種方法還無法作純度鑒定，只有幾種方法聯(lián)合應(yīng)用才較可靠。結(jié)晶法不是純度的標(biāo)準(zhǔn)，因結(jié)晶中往往含有其它成分。電泳譜中呈現(xiàn)單一區(qū)帶也不能排除在這條帶中含有其他成分。有時雖出現(xiàn)幾條帶，也可能是同一物質(zhì)的聚合體或降解物醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

蛋白抗原的定量可用生化分析中的常用方法。根據(jù)測試抗原量的多少可用雙縮脲法或酚試劑法。如果抗原極為寶貴，可用紫外光吸收法。