各條DNA螺旋間的交互作用不常發(fā)生，在人類細(xì)胞核里的每個(gè)染色體，各自擁有一塊稱作“染色體領(lǐng)域”的區(qū)域。染色體之間在物理上的分離，對(duì)于維持DNA資訊儲(chǔ)藏功能的穩(wěn)定性而言相當(dāng)重要。

不過染色體之間有時(shí)也會(huì)發(fā)生重組，在重組的過程中，會(huì)進(jìn)行染色體互換：首先兩條DNA螺旋會(huì)先斷裂，之后交換其片段，最后再重新黏合。重組作用使染色體得以互相交換遺傳訊息，并產(chǎn)生新的基因組合，進(jìn)而增加自然選擇的效果，且可能對(duì)蛋白質(zhì)的演化產(chǎn)生重要影響。遺傳重組也參與DNA修復(fù)作用，尤其是當(dāng)細(xì)胞中的DNA發(fā)生斷裂的時(shí)候醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。

同源重組是最常見的染色體互換方式，可發(fā)生于兩條序列相類似的染色體上。而非同源重組則對(duì)細(xì)胞具有傷害性，會(huì)造成染色體易位與遺傳異常。可催化重組反應(yīng)的酵素，如RAD51，稱為“重組酶”。重組作用的第一個(gè)步驟，是內(nèi)切酶作用，或是DNA的損壞所造成的DNA雙股斷裂。重組酶可催化一系列步驟，使兩條螺旋結(jié)合產(chǎn)生Holliday交叉。其中每條螺旋中的單股DNA，皆與另一條螺旋上與之互補(bǔ)的DNA連結(jié)在一起，進(jìn)而形成一種可于染色體內(nèi)移動(dòng)的交叉形構(gòu)造，造成DNA鏈的互換。重組反應(yīng)最后會(huì)因?yàn)榻徊娼Y(jié)構(gòu)的斷裂，以及DNA的重新黏合而停止。