按照抗原分子的化學(xué)性質(zhì)，可將抗原分成蛋白抗原、多糖抗原和核酸抗原等許多類型。

天然蛋白質(zhì)的分子組成都比較復(fù)雜，且具有二級和三級結(jié)構(gòu)，因此多是良好的抗原。多糖的免疫原性一般較弱，但某些結(jié)構(gòu)復(fù)雜的多糖，例如人類ABO血型抗原等，也具有較強(qiáng)的免疫原性。核酸和脂類多無免疫原性，與蛋白質(zhì)結(jié)合后形成核蛋白或脂蛋白時(shí)可成為良好的抗原；在系統(tǒng)性紅斑狼瘡等自身免疫病患者體內(nèi)可發(fā)現(xiàn)抗DNA或抗RNA的抗體，所以核酸也許是一種天然的半抗原。