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病毒是如何進(jìn)化的?

2009-12-02 09:51 來源:
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  人類擁有的病毒記錄,或者病毒癥狀的記錄,僅能追述到有記載的幾千年前。而病毒的比較學(xué)研究,最多也只有80來年的歷史。通過研究現(xiàn)存的病毒,人們希望能夠了解病毒的起源和進(jìn)化歷程,預(yù)示病毒特別是人類病原病毒未來的變異和進(jìn)化的方向,也即需要了解隨著環(huán)境因素的變化,病毒將怎樣變異? 變異的速度如何? 什么是變異的選擇壓力等? 從而能夠有效地控制和避免人類及動(dòng)物病毒的爆發(fā)。

  要討論病毒起源的學(xué)說,必須首先定義什么是病毒的起源以及如何判斷這個(gè)起源的發(fā)生。這里我們將病毒或其遺傳物質(zhì)從它的前身大分子中獨(dú)立出來進(jìn)行自主復(fù)制和進(jìn)化的時(shí)候,定義為病毒的起源。當(dāng)病毒獲得了決定自身繁殖和命運(yùn)的遺傳信息量時(shí),它就獲得了新的分類地位成為獨(dú)立的遺傳元件。

  病毒的起源有三類學(xué)說:

  (1)退化性起源學(xué)說。退化性起源學(xué)說認(rèn)為病毒是細(xì)胞內(nèi)寄生物的退化形式。這種細(xì)胞內(nèi)寄生的產(chǎn)生原因可能是由于微生物對(duì)某種不能穿過細(xì)胞膜的代謝發(fā)生了嚴(yán)重依賴。在細(xì)胞內(nèi),這類寄生物可以在不影響其生存的情況下逐漸丟失部分生物學(xué)功能。它們所必需保留的功能是具有可進(jìn)行自主復(fù)制的DNA復(fù)制原點(diǎn)(順式元件)、可以對(duì)復(fù)制進(jìn)行調(diào)控的反式調(diào)控蛋白,以及能與宿主生物合成及復(fù)制系統(tǒng)相互作用的順式和反式功能。最終的選擇結(jié)構(gòu),就可產(chǎn)生一種專性細(xì)胞內(nèi)寄生的DNA分子或質(zhì)粒。

  退化性起源學(xué)說可以把病毒的起源解釋為兩個(gè)階段:首先,寄生物在細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生獨(dú)立復(fù)制的DNA質(zhì)粒,然后,編碼寄生物亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)單位的基因發(fā)生突變,形成病毒的衣殼蛋白。隨著進(jìn)化的發(fā)生,新獲得的可在細(xì)胞間轉(zhuǎn)移的特性被進(jìn)一步選擇下來。

  (2)病毒起源于宿主細(xì)胞中的RNA和(或)DNA成分的學(xué)說。這種學(xué)說認(rèn)為,病毒是正常的細(xì)胞組分在進(jìn)化過程中獲得了自主復(fù)制的能力獨(dú)立進(jìn)化而來的。該學(xué)說能解釋所有病毒的起源:DNA病毒起源于質(zhì)?;蜣D(zhuǎn)移因子;反轉(zhuǎn)錄病毒起源于反轉(zhuǎn)座子;RNA病毒起源于自主復(fù)制的mRNA.

  (3)病毒起源于具有自主復(fù)制功能的原始大分子的學(xué)說,即病毒起源于自主復(fù)制的RNA分子。核糖核酸多聚體具有自主復(fù)制的信息和能力。由于發(fā)現(xiàn)RNA分子具有催化化學(xué)反應(yīng)的能力使得RNA為生命和病毒的起源的學(xué)說變得更具有吸引力。小而簡(jiǎn)單的RNA分子具有至少下列三種化學(xué)功能:

  1)核糖核酸酶的活性;

  2)能自我拼接去掉內(nèi)部的核酸序列(核酸);

  3)有實(shí)驗(yàn)表明,以RNA作引物可以合成依賴于模板的多聚胞嘧啶核酸。也就是說,RNA分子可以進(jìn)行復(fù)制和進(jìn)化相關(guān)的三個(gè)基本反應(yīng)。

  這些觀察都有利于RNA是現(xiàn)今生物的進(jìn)化起源的學(xué)說。首先是RNA的形成和復(fù)制,然后演變出RNA-蛋白介導(dǎo)的一系列反應(yīng),第三步產(chǎn)生了DNA.DNA由于比RNA穩(wěn)定而最終成為遺傳信息。RNA的反應(yīng)性有利于它作為催化物而不利于它成為遺傳物質(zhì)。有些分子被包裝在細(xì)胞和組織中,形成宿主細(xì)胞,另一些分子則自我復(fù)制或寄生在宿主細(xì)胞中,進(jìn)化成為病毒。這一理論認(rèn)為病毒與宿主是共進(jìn)化的。現(xiàn)今的類病毒和衛(wèi)星RNA,仍保留有部分的RNA催化性能,因而被一些學(xué)者認(rèn)為是生命形式出現(xiàn)以前的RNA世界的化石。

  研究病毒的進(jìn)化有多種方法,可以通過序列同源性、基因組排列順序、基因組的基因組成等方面構(gòu)建病毒的進(jìn)化樹。單基因的進(jìn)化樹并不一定代表病毒的進(jìn)化樹,多個(gè)基因串聯(lián)所獲得的進(jìn)化樹比單基因的進(jìn)化樹具有更好的穩(wěn)定性。基因組的排列順序與單基因的進(jìn)化分析從兩個(gè)不同的側(cè)面反映了病毒的進(jìn)化。研究基因組成的演化對(duì)揭示基因的起源及病毒與宿主之間的關(guān)系具有重要意義。

  DNA病毒和RNA病毒的進(jìn)化。突變和重組都是DNA病毒進(jìn)化的決定因素。DNA病毒容易在宿主體內(nèi)形成持續(xù)性或慢性感染,它們可以在宿主體內(nèi)存在多年而后爆發(fā),其間可能幾乎不發(fā)生變異,因此,這類病毒的變異速率可能表現(xiàn)得比裂解型病毒慢一些。一般來講,DNA病毒不會(huì)像RNA病毒那樣引起人類世界范圍的流行性疾病醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)搜集整理。

  RNA病毒引起的疾病流行和變異成為研究RNA病毒進(jìn)化,特別是進(jìn)化時(shí)間的良好素材。

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