這一時期起始于18世紀末至20世紀中。其特點是人們對免疫功能的認識從人體現(xiàn)象的觀察進入了科學實驗時期。它的發(fā)展是與微生物學的發(fā)展密切相關(guān)的，并成為微生物學的一個分支。這一時期內(nèi)的重要成就如下述。

　　1.牛痘苗的發(fā)明 繼人痘苗之后，免疫學的一個重要發(fā)展首推牛痘苗的發(fā)明。它不但彌補了人痘苗的不足，并且可在實驗室大量生產(chǎn)，于1804年傳入我國后很快代替了人痘苗。

　　牛痘苗的發(fā)明應(yīng)歸功于英國醫(yī)生Jenner，他觀察到擠奶女工在患過牛痘后不易得天花病的事實后，通過對牛痘苗人體的長期實驗，確證接種牛痘苗后可以預(yù)防天花，并對人體無害。在1793年發(fā)表了他的牛痘苗著作，為人類傳染病的預(yù)防開創(chuàng)了人工免疫的先聲。

　　2.減毒疫苗的發(fā)明 免疫學的發(fā)展自Jenner發(fā)明牛痘苗之后，停滯了將近一個世紀。進入19世紀后微生物學在法國免疫學家Pasteur和德國細菌學家Koch 等人的努力下得到了迅速發(fā)展。在方法學上創(chuàng)造性地解決了細菌的分離培養(yǎng)，從而能獲得純種細菌，為人工菌苗的制備創(chuàng)造了條件。Pasteur更有意識的研究獲得減毒菌株的方法，通過系統(tǒng)的科學實驗，終于發(fā)現(xiàn)了應(yīng)用物理、化學以及生物學方法可獲得減毒菌株。

　　在1881年 Pasteur應(yīng)用高溫培養(yǎng)法獲得了減毒株，從而制備了炭疸菌苗。醫(yī).學教育網(wǎng)搜集整理其后他又將狂犬病毒在兔體內(nèi)經(jīng)連續(xù)傳代獲得了減毒株，從而制備了炭疸菌苗。巴氏減毒菌苗的發(fā)明為實驗免疫學建立了基礎(chǔ)。

　　3.抗毒素的發(fā)明 德國學者Behring和日本學者北里于1890年在Koch研究所應(yīng)用白喉外毒素給動物免疫，發(fā)現(xiàn)在其血清中有一種能中和外毒素的物質(zhì)，稱為抗毒素。將這種免疫血清轉(zhuǎn)移給正常動物也有中和外毒素的作用。醫(yī).學教育網(wǎng)搜集整理這種被動免疫法很快應(yīng)用于臨床治療。Behring于1891年應(yīng)用來自動物的免疫血清成功地治療了一個白喉患者，這是第一個被動免疫治療的病例。為此他于1902年獲得了諾貝爾醫(yī)學獎。

　　4.補體的發(fā)現(xiàn) 19世紀末，繼抗毒素之后，又限快發(fā)現(xiàn)了免疫溶菌現(xiàn)象。Pfeiffer（1894）用新鮮免疫血清在豚鼠體內(nèi)觀察到對霍亂弧菌的溶菌現(xiàn)象。Bordet發(fā)現(xiàn)如將新鮮免疫血清加熱60℃30分鐘可喪失溶能力。他認為在新鮮免疫血清內(nèi)存在二種不同物質(zhì)與溶菌作用有關(guān)。一種對熱穩(wěn)定的物質(zhì)稱為溶菌素即抗體，有特異性，另一種對熱不穩(wěn)定的物質(zhì)，可存在于正常血清中，為非特異性成分，稱之為補體。它具有溶菌或溶細胞作用，但這種作用必需有抗體存在才能實現(xiàn)。

　　5.血清學方法的建立 在抗毒素發(fā)現(xiàn)以后的10年中，相繼在免疫血清中發(fā)現(xiàn)有溶菌素、凝集素、沉淀素等特異性組分，并能與其相應(yīng)細胞或細菌發(fā)生反應(yīng)。其后將多種不同的特異性反應(yīng)物質(zhì)統(tǒng)稱之為抗體。將能引起抗體產(chǎn)生的物質(zhì)統(tǒng)稱之為抗原，自此建立了抗原、抗體的概念。在此期間建立了各種體外檢測抗原、抗體反應(yīng)的血清學技術(shù)如沉淀反應(yīng)、凝集反應(yīng)、補體結(jié)合反應(yīng)等方法，為病原菌的鑒定和血清抗體的檢查提供了可靠的方法。從而大大有助于傳染病的診斷學和流行病學調(diào)查，而動物免疫血清的制備又開創(chuàng)了被動血清療法。