北京中醫(yī)藥大學管理學院機構設置：

管理學院教學機構健全，擁有一座面積1700平方米的教學辦公樓醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理。公共事業(yè)管理教學部、工商管理教學部、專業(yè)基礎教學部和公共基礎教學部；兩個實驗室：科研實驗室和教學實驗室。

學院另外設有培訓部，主要承擔行業(yè)主管部門委托的中醫(yī)藥機構管理干部繼續(xù)教育培訓任務，開辦各種層次的中醫(yī)藥管理干部在職的專業(yè)學歷教育與非學歷教育，并接受中醫(yī)藥企、事業(yè)單位委托的各項培訓工作。

學院已經(jīng)成立和正在籌建的研究機構包括：衛(wèi)生經(jīng)濟研究所（中醫(yī)醫(yī)療機構成本測算中心、中醫(yī)藥統(tǒng)計中心）、醫(yī)院管理研究所、藥事企業(yè)管理研究所（藥事管理與咨詢中心、企業(yè)診斷中心）、心理學研究所、東方管理研究所。

全院已實現(xiàn)計算機聯(lián)網(wǎng)，實現(xiàn)了科研、教學、辦公的網(wǎng)絡化管理。