南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的前身為中央大學(xué)醫(yī)學(xué)院，創(chuàng)建于1935年，1949年解放后改名為南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院，1951年劃歸部隊系統(tǒng)，1987年經(jīng)教育部（原國家教委）批準重建，成為教育部直屬的第一所綜合性大學(xué)七年制醫(yī)學(xué)院。本院辦學(xué)方針是小規(guī)模、研究型、國際化，目標是培養(yǎng)未來醫(yī)學(xué)領(lǐng)軍人才，辦學(xué)理念和人才培養(yǎng)獨具特色�，F(xiàn)設(shè)臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和口腔醫(yī)學(xué)三個專業(yè)，學(xué)制七年。有臨床醫(yī)學(xué)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)二個一級學(xué)科碩士點及口腔臨床醫(yī)學(xué)一個二級學(xué)科碩士點，有生理學(xué)、內(nèi)科學(xué)、外科學(xué)三個博士點和博士后流動站，其中普通外科學(xué)為國家重點學(xué)科。培養(yǎng)臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)和口腔醫(yī)學(xué)碩士和博士研究生。

以南京鼓樓醫(yī)院、南京軍區(qū)南京總醫(yī)院（金陵醫(yī)院）和南京口腔醫(yī)院作為附屬醫(yī)院，并以南京市各專科醫(yī)院作為教學(xué)醫(yī)院，師資力量雄厚，現(xiàn)有中國工程院院士3人，博士生導(dǎo)師42人，教授124人，副教授179人。教學(xué)和科研成果顯著，曾獲得1996年教育部科技進步三等獎，1997年江蘇省教學(xué)成果一等獎和國家級教學(xué)成果二等獎， 1998年教育部科技進步三等獎， 1999年教育部科技進步三等獎， 2000年中國高校科學(xué)技術(shù)二等獎，2002年度教育部提名國家科學(xué)技術(shù)獎一等獎和二等獎，2003年度教育部提名國家科學(xué)技術(shù)獎二等獎，2005年江蘇省教學(xué)成果一等獎，2008年教育部科技進步一等獎和自然科學(xué)二等獎。

憑借南京大學(xué)雄厚的自然科學(xué)基礎(chǔ)，濃郁的學(xué)術(shù)和人文氛圍，本院尤其注重加強學(xué)生的基礎(chǔ)理論、創(chuàng)新思維及科研能力和人文素質(zhì)的培養(yǎng)，教學(xué)內(nèi)容反映現(xiàn)代水平，并開設(shè)大量與現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論和臨床有關(guān)的選修課，使學(xué)生既具有廣博而堅實的生命科學(xué)和自然科學(xué)基礎(chǔ)，又掌握現(xiàn)代醫(yī)學(xué)理論和必要的臨床知識與實踐機能。

國際交流頻繁，與澳大利亞西澳大學(xué)醫(yī)學(xué)院、香港中文大學(xué)醫(yī)學(xué)院簽署學(xué)生交流協(xié)議，每年遴選優(yōu)秀學(xué)生赴上述大學(xué)醫(yī)學(xué)院進行為期3月和5周的交流。

除了學(xué)校的各類獎、助學(xué)金外，本院專設(shè)有“吳階平基金會優(yōu)秀貧困大學(xué)生助學(xué)專項基金”和“校友助學(xué)專項基金”等助學(xué)金，資助品學(xué)兼優(yōu)、家境貧寒的學(xué)生完成學(xué)業(yè)；還專設(shè)有“香港孫明杰基金會威爾曼優(yōu)秀研究生獎學(xué)金”，獎勵優(yōu)秀研究生。

學(xué)生順利完成學(xué)業(yè)，可獲得碩士學(xué)位，成績優(yōu)秀者可八年一貫，直接攻讀博士學(xué)位。

建院二十二年來，南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院已培養(yǎng)十五屆畢業(yè)生，其中博士202名，碩士830名。醫(yī)'學(xué)教育網(wǎng)|整理這些畢業(yè)生極大多數(shù)在全國各大城市的三級甲等醫(yī)院中從事臨床工作，在工作中都有出色的表現(xiàn)，其中一部分在業(yè)務(wù)上已有所建樹或成為所在單位的骨干。用人單位在評價南京大學(xué)醫(yī)學(xué)院的畢業(yè)生時一致認為：該院畢業(yè)生基礎(chǔ)扎實、思維敏捷、知識面寬、外語好、計算機能力強，有較強的研究能力和創(chuàng)新能力，并十分關(guān)注醫(yī)學(xué)發(fā)展的前沿動態(tài)，在醫(yī)學(xué)臨床和研究領(lǐng)域有很強的競爭力。