揚州大學醫(yī)學院具有50多年的辦學歷史，是一所在全國首批設置臨床醫(yī)學（婦產(chǎn)科學專業(yè)方向）、率先招收中醫(yī)學（中西醫(yī)結(jié)合專業(yè)方向）、四年制護理學本科專業(yè)的醫(yī)學院，也是迄今在全國唯一開設臨床醫(yī)學（皮膚性病防治專業(yè)方向）的醫(yī)學院。自1989年以來，學院成為衛(wèi)生部皮膚性病防治人才培養(yǎng)基地、司法部監(jiān)獄管理醫(yī)學和罪犯心理矯治等人才培訓基地、勞動和社會保障部國家職業(yè)技能鑒定中心和司法部監(jiān)獄管理局心理咨詢師培訓基地。

揚州大學醫(yī)學院現(xiàn)設臨床醫(yī)學（含婦產(chǎn)科學專業(yè)方向，皮膚病學與性病學專業(yè)方向）、中醫(yī)學（中西醫(yī)結(jié)合專業(yè)方向）、護理學、藥學（臨床藥學方向）等六個本科專業(yè)和方向，其中臨床醫(yī)學和中醫(yī)學專業(yè)學制5年，護理學、藥學專業(yè)學制4年。從2006年起，臨床醫(yī)學專業(yè)開始招收學制5年的外國留學生。設有中西醫(yī)結(jié)合臨床博士點，人體解剖與組織胚胎學、生理學、免疫學、病理學和病理生理學、藥理學、內(nèi)科學、外科學、婦產(chǎn)科學、皮膚性病防治學、影像與核醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)結(jié)合基礎和臨床等13個碩士學位點。其中中西醫(yī)結(jié)合臨床為省級重點學科，中藥學、免疫學、內(nèi)科學、外科學、人體解剖與組織胚胎學、生理學、病理與病理生理學為校級重點學科。目前學院有全日制本科學生和碩士研究生2254人，在校外國留學生42名。

揚州大學醫(yī)學院設有臨床醫(yī)學系、中醫(yī)學系、護理學系、藥學系和基礎醫(yī)學部，擁有基礎醫(yī)學教學實驗中心、臨床醫(yī)學教學實驗中心、一個藥學綜合教學實驗室。擁有江蘇省蘇北人民醫(yī)院、揚州市第一人民醫(yī)院等四所臨床醫(yī)學院；還有30余所教學實習醫(yī)院。

學院重視科學研究，近幾年共承擔國家自然科學基金項目、省重大招標項目等課題30余項，取得了一批高水平的科研成果，產(chǎn)生了顯著的社會效益和經(jīng)濟效益。學院設有《實用臨床醫(yī)藥雜志》編輯部，該雜志為全國公開發(fā)行的核心學術(shù)期刊，影響因子0.356，2006年獲教育部“首屆中國高校優(yōu)秀期刊獎”。

建校以來，已為國家培養(yǎng)各類高中級醫(yī)療衛(wèi)生人才10000余人，遍及全國各地。學院畢業(yè)生以求知欲強，基礎理論扎實，實踐能力較強，作風樸實而受到用人單位好評，其中一大批成為醫(yī)療衛(wèi)生行業(yè)的骨干力量。全國優(yōu)秀共產(chǎn)黨員、勞動模范、白求恩獎章獲得者、被譽為“白衣圣人”的吳登云同志，是學院優(yōu)秀畢業(yè)生的杰出代表。