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學(xué)校設(shè)有9個(gè)系、部，3個(gè)二級(jí)學(xué)院，有中醫(yī)骨傷科學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合臨床2個(gè)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合3個(gè)一級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)，18個(gè)二級(jí)學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)；有中醫(yī)學(xué)、七年制中醫(yī)學(xué)、針灸推拿學(xué)、中西醫(yī)臨床醫(yī)學(xué)、臨床醫(yī)學(xué)、醫(yī)學(xué)影像學(xué)、藥學(xué)、中藥學(xué)、藥物制劑、制藥工程、市場(chǎng)營(yíng)銷、護(hù)理學(xué)、公共事業(yè)管理、應(yīng)用心理學(xué)等14個(gè)本科專業(yè)。現(xiàn)有全日制在校生8472人，其中研究生873人。

全校現(xiàn)有教職醫(yī)護(hù)員工2462人（含直屬附屬單位），其中副高以上專業(yè)技術(shù)人員355人，博士生導(dǎo)師30人、碩士生導(dǎo)師282人；擁有一批國(guó)家級(jí)名老中醫(yī)學(xué)術(shù)繼承人指導(dǎo)老師、國(guó)家有突出貢獻(xiàn)的中青年專家、福建省優(yōu)秀專家、國(guó)務(wù)院津貼專家等，師資力量雄厚。2002年12月，學(xué)校在教育部組織的第一輪本科教學(xué)水平評(píng)估中獲得“優(yōu)秀”成績(jī)。

學(xué)校建立了完善的學(xué)科體系。中醫(yī)骨傷科學(xué)為國(guó)家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)學(xué)科，也是福建省“211工程”重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科。此外，還有7個(gè)福建省重點(diǎn)學(xué)科，1個(gè)福建省重點(diǎn)扶持學(xué)科。2003年以來(lái)，作為福建省八所重點(diǎn)建設(shè)高校之一，學(xué)校以學(xué)科建設(shè)為核心，重點(diǎn)建設(shè)了中醫(yī)學(xué)、中西醫(yī)結(jié)合、中藥學(xué)等學(xué)科，帶動(dòng)護(hù)理學(xué)、心理學(xué)、情報(bào)學(xué)、管理學(xué)等學(xué)科的發(fā)展，取得了顯著的成績(jī)。

全校有2個(gè)研究院：福建省中醫(yī)藥研究院、福建中西醫(yī)結(jié)合研究院；2個(gè)國(guó)家（局級(jí)）三級(jí)科研實(shí)驗(yàn)室，3個(gè)省級(jí)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室；2個(gè)省級(jí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心；1個(gè)國(guó)家食品藥品監(jiān)督管理局臨床藥理基地。學(xué)校開展的經(jīng)絡(luò)研究、中醫(yī)骨傷科學(xué)基礎(chǔ)研究、中西醫(yī)結(jié)合老年病研究、中醫(yī)證的研究、白內(nèi)障基礎(chǔ)與臨床研究、中草藥規(guī)范化種植與開發(fā)利用、中醫(yī)藥信息研究以及閩臺(tái)中醫(yī)藥文化研究等項(xiàng)目居于全國(guó)先進(jìn)行列。醫(yī)'學(xué)教育網(wǎng)|整理附屬福州屏山制藥廠是科研成果轉(zhuǎn)化的重要基地。

學(xué)校有福建省人民醫(yī)院、福建省第二人民醫(yī)院以及福州市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院、廈門市中醫(yī)院、泉州市中醫(yī)院、漳州市中醫(yī)院、寧德市醫(yī)院、三明市中西醫(yī)結(jié)合醫(yī)院等8所附屬醫(yī)院，臨床基地實(shí)力雄厚，體系健全。福建省人民醫(yī)院和福建省第二人民醫(yī)院有7個(gè)國(guó)家中醫(yī)藥管理局局級(jí)重點(diǎn)�？啤�專病，12個(gè)省級(jí)重點(diǎn)�？啤�專病。校本部設(shè)立國(guó)醫(yī)堂醫(yī)院，為社會(huì)提供服務(wù)。

學(xué)校辦學(xué)條件優(yōu)越。旗山校區(qū)占地面積935畝，屏山校區(qū)占地面積161畝。基本建成的旗山校區(qū)建設(shè)配備了現(xiàn)代化的教學(xué)、科研、行政、生活等設(shè)施。圖書館文獻(xiàn)總量達(dá)135萬(wàn)冊(cè)，館藏圖書豐富，具備了新一代的網(wǎng)絡(luò)存儲(chǔ)架構(gòu)“ＳＡＮ架構(gòu)”，存儲(chǔ)容量達(dá)到 30ＴＢ；校園網(wǎng)設(shè)備先進(jìn)。

學(xué)校1998年、2000年、2002年、2006年四次被福建省委、福建省人民政府授予“文明校園”榮譽(yù)稱號(hào)。

學(xué)校是一所外向型大學(xué)，已與澳大利亞、馬來(lái)西亞、新加坡、臺(tái)灣、香港等國(guó)家和地區(qū)的十多個(gè)高等院校、科研醫(yī)療機(jī)構(gòu)、學(xué)術(shù)團(tuán)體合作開辦博士、碩士、本科、專升本等各種層次的學(xué)生培養(yǎng)；與丹麥、瑞典有關(guān)大學(xué)達(dá)成了互派師生訪問(wèn)和到對(duì)方學(xué)校選修課程的協(xié)議；與美國(guó)、德國(guó)、日本等二十幾個(gè)國(guó)家和地區(qū)開展了經(jīng)常性的考察、講學(xué)、醫(yī)療和學(xué)術(shù)交流活動(dòng)，為中醫(yī)藥走向世界做出了貢獻(xiàn)。學(xué)校是內(nèi)地第一所招收臺(tái)灣學(xué)生的中醫(yī)藥院校，對(duì)臺(tái)交流與合作是學(xué)校的辦學(xué)特色�，F(xiàn)有臺(tái)港澳學(xué)生及外國(guó)留學(xué)生471名，其中多數(shù)為臺(tái)灣學(xué)生。學(xué)校還與臺(tái)灣元培科技大學(xué)合作創(chuàng)辦影像學(xué)專業(yè)，與臺(tái)灣大仁科技大學(xué)合作創(chuàng)辦食品科學(xué)與工程專業(yè)；與臺(tái)灣有關(guān)機(jī)構(gòu)開展科研、中藥研發(fā)、貿(mào)易等方面的合作，并組織學(xué)生赴臺(tái)灣參加交流活動(dòng)。

在新的發(fā)展階段，全校師生醫(yī)護(hù)員工將進(jìn)一步更新觀念，開拓進(jìn)取，努力把學(xué)校建設(shè)成為一所以中醫(yī)藥為主，多學(xué)科協(xié)調(diào)發(fā)展，培養(yǎng)高層次中醫(yī)藥與中西醫(yī)結(jié)合人才，弘揚(yáng)閩臺(tái)中醫(yī)藥文化，服務(wù)海峽西岸經(jīng)濟(jì)區(qū)，具有鮮明辦學(xué)特色的現(xiàn)代外向型中醫(yī)藥知名大學(xué)。