麻醉科成立于1956年。在西南地區(qū)率先成立麻醉學(xué)教研室。1985年經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)為碩士學(xué)位授予點(diǎn)。1999年經(jīng)國家教委批準(zhǔn)，正式成立重慶醫(yī)科大學(xué)麻醉學(xué)系。2005年經(jīng)國務(wù)院批準(zhǔn)為一級臨床醫(yī)學(xué)學(xué)科博士點(diǎn)。 歷屆主任：董紹賢、蔣夏、房秀生、陳敦敏、李秀英。

現(xiàn)任主任：閔蘇、陳萍。

該科立足臨床麻醉并已發(fā)展成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研為一體的二級臨床學(xué)科。是重慶及西南地區(qū)麻醉技術(shù)力量和麻醉學(xué)專業(yè)教學(xué)實(shí)力最雄厚的科室及系部之一。擁有全國第一個(gè)麻醉學(xué)教學(xué)實(shí)驗(yàn)室，一個(gè)重慶市級醫(yī)學(xué)中心（重慶市第一個(gè)疼痛治療中心）。已形成了較為完善的現(xiàn)代麻醉學(xué)科體系，即臨床麻醉，急救與復(fù)蘇，PACU，疼痛診療。

全科有教授3位、副教授9位。博士導(dǎo)師1名、碩士導(dǎo)師7名。40歲以下師資均為博士和碩士。多人出國學(xué)習(xí)，目前有一名赴美國進(jìn)行麻醉藥理學(xué)的博士后研究。