所屬系統(tǒng)不同

由國家人事部和食品藥品監(jiān)督管理局組織的，屬于藥監(jiān)系統(tǒng)。

國家衛(wèi)計委組織的，屬于衛(wèi)生系統(tǒng)。

報名時間不同

報名一般會在每年的7、8月左右。

一般會在每年的年底進行。

考試時間不同

一般是在每年的10月中下旬。

一般是在每年的5月份。

考試類型不同

考試科目有四門，分別為藥事管理與法規(guī)、（中）藥學(xué)專業(yè)知識（一）、（中）藥學(xué)專業(yè)知識（二）、（中）藥學(xué)綜合知識與技能。

考試科目也有四門，分別為基礎(chǔ)知識、相關(guān)專業(yè)知識、專業(yè)知識、專業(yè)實踐能力。

報考要求不同

以本科為例，畢業(yè)從事相關(guān)工作3年才可以考執(zhí)業(yè)藥師。

執(zhí)業(yè)藥師的工作證明可以是藥企開具，專業(yè)只要是藥學(xué)相關(guān)就可以。

本科畢業(yè)一年就可以考初級藥師。

藥師的工作證明必須是醫(yī)院、社區(qū)衛(wèi)生所開出，畢業(yè)院校必須是相關(guān)目錄中規(guī)定的才可以。

使用方向不同

考取之后一般是在藥店使用，國家規(guī)定每個藥店必須配備一個執(zhí)業(yè)藥師。

初級藥師是技術(shù)職稱，需要由單位進行聘任。