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表達譜差異分析:
表達譜差異分析主要包括基因表達譜和蛋白質(zhì)表達譜。大規(guī)模表達譜分析已經(jīng)成為認識疾病分子機制的有利方法,在癌癥研究等方面取得了一定的進展。成功的表達譜分析基于實驗及其過程分析的有機結(jié)合。實驗過程從關(guān)注的疾病開始,首先收集大量的疾病相關(guān)組織樣本,樣本數(shù)量可從10多個到數(shù)百個,但必須足以對每一組織類型及個體差異進行比較分析,而且許多情況下不能僅簡單地分為正常和疾病組織。例如,在對糖尿病的研究中,所收集的樣本來自健康人、胰島素耐受和糖尿病病人的不同試驗階段,如胰島素治療前后。樣品還應(yīng)包括其他器官的取材,以便進行基因表達的組織分布研究。為了便于對后來的實驗數(shù)據(jù)進行分析管理,需采集并儲存所有的組織樣本和臨床參數(shù)。接下來進行組織樣本的處理,利用生物芯片(寡核苷酸芯片、cDNA芯片或全基因組芯片)進行表達譜測定,并進行生物信息學(xué)分析。
通常,表達譜的分析結(jié)果需進一步的實驗加以證實。定量RT2PCR是最靈敏的確證方法,該方法還可以將確證實驗的范圍擴大到原測組織以外的更廣泛的組織和組織類型,揭示基因表達的組織分布情況醫(yī)`學(xué)教育網(wǎng)搜集整理。
確證實驗揭示了疾病相關(guān)基因。據(jù)此,可以進行進一步研究,探索這些基因的功能,開發(fā)新的治療手段。例如,對于正常和疾病組織中表達有顯著性變化的基因,可以進行新治療靶點的鑒定和確定研究,或利用實驗和分析工具研究分析其功能;對于疾病組織中活性升高的酶,可以當(dāng)作前藥活化酶進行鑒定研究。典型的表達譜能夠顯示疾病過程中有大量的已知基因表達的改變,而許多已知基因的代謝通路、表達產(chǎn)物酶學(xué)分類和蛋白質(zhì)功能業(yè)已發(fā)表,將兩者對照分析,可以鑒定出酶活性,選擇其中可能成為前藥活化酶的部分進行進一步研究;對于疾病特異的蛋白質(zhì),可以進行抗原表型分析,決定疫苗的開發(fā)策略。
尋找差異表達基因的方法除芯片技術(shù)外,一些新的檢測方法如差異顯示PCR、消減雜交,等也相繼得到結(jié)合應(yīng)用。
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