三國時期，魏承漢代醫(yī)官制度，有太醫(yī)令、丞、尚藥監(jiān)、藥長寺人監(jiān)、靈芝園監(jiān)等官職。《太平御覽》引《玉匱針經(jīng)序》中有吳置太醫(yī)令的記載，蜀漢醫(yī)制無考。

　　晉代承襲漢魏官制，設(shè)有太醫(yī)令等職。據(jù)記載：晉代太醫(yī)令銅印墨綬，統(tǒng)屬于宗正，又有尚藥監(jiān)、藥長寺人監(jiān)。東晉時，省宗正合并于太常，原隸屬于宗正的太醫(yī)官屬，后改隸于門下省。門下眾事為為侍中所掌，這是后代以太醫(yī)令隸于侍中的開始。

　　南朝醫(yī)官，劉宋有“太醫(yī)令一人，丞一人，隸侍中”。齊有“太醫(yī)令一人，丞一人，屬起部亦屬領(lǐng)軍”?！顿Y治通鑒》記載齊有御師。梁有太醫(yī)令一人，丞二人，屬門下省。醫(yī)學教|育網(wǎng)搜集整理又有太子官屬的藥藏局設(shè)置藥藏丞。諸王國官屬，有典醫(yī)丞?？たh屬吏亦有醫(yī)職?！侗笔?middot;姚僧垣傳》載又有太醫(yī)正之設(shè)。《冊府元龜》記載梁以后，尚藥職事由太醫(yī)兼任，陳如梁制。

　　北朝醫(yī)官，北魏有太醫(yī)令等職，屬太常。門下省設(shè)有尚藥局，有侍御師?！段簳?middot;官氏志》記有太醫(yī)博士（七品下）和太醫(yī)助教（九品中）之設(shè)。北齊有太醫(yī)署，設(shè)太醫(yī)令、丞等職，屬太常。太子門下坊設(shè)有藥藏局，置監(jiān)、丞各二人，侍醫(yī)四人?；首油鯂髦玫溽t(yī)丞二人。中侍中省設(shè)有中尚藥典御二人，丞二人；門下省置尚藥局，設(shè)典御二人，丞二人，侍御師四人，尚藥監(jiān)四人，尚書省、門下省和中書省內(nèi)均設(shè)有醫(yī)師。北周有太醫(yī)下大夫、小醫(yī)下大夫、小醫(yī)上士、瘍醫(yī)上士、瘍醫(yī)中士、瘍醫(yī)下士、醫(yī)正上士、醫(yī)正中士、醫(yī)正下士、食醫(yī)下士、主藥下士，均屬于天官。魯醫(yī)上士、獸醫(yī)中士、獸醫(yī)下士，均屬于夏官，其官品高者為正四命，低者為正一命。

　　由上述可知：此時期中央醫(yī)官機構(gòu)較前更為細密，特別是北周，不僅已細分為太醫(yī)、獸醫(yī)等七類，各類又再分階，形成了自上而下的等級系統(tǒng)。這對醫(yī)績的考核管理和促進業(yè)務水平的提高，都是有利的。至于地方醫(yī)政，除梁有“郡縣屬吏亦有醫(yī)職”之記載外，其他不知其詳。