國家食品藥品監(jiān)督管理局的主要職能主要包括以下幾點：

　　1.組織有關(guān)部門起草食品、保健品、化妝品安全管理方面的法律、行政法規(guī)；組織有關(guān)部門制定食品、保健品、化妝品安全管理的綜合監(jiān)督政策、工作規(guī)劃并監(jiān)督實施。

　　2.依法行使食品、保健品、化妝品安全管理的綜合監(jiān)督職責(zé)，組織協(xié)調(diào)有關(guān)部門承擔(dān)的食品、保健品、化妝品安全監(jiān)督工作。

　　3.依法組織開展對食品、保健品、化妝品重大安全事故的查處；根據(jù)國務(wù)院授權(quán)，組織協(xié)調(diào)醫(yī).學(xué)教育網(wǎng)搜集整理開展全國食品、保健品、化妝品安全的專項執(zhí)法監(jiān)督活動；組織協(xié)調(diào)和配合有關(guān)部門開展食品、保健品、化妝品安全重大事故應(yīng)急救援工作。

　　4.綜合協(xié)調(diào)食品、保健品、化妝品安全的檢測和評價工作；會同有關(guān)部門制定食品、保健品、化妝品安全監(jiān)管信息發(fā)布辦法并監(jiān)督實施，綜合有關(guān)部門的食品、保健品、化妝品安全信息并定期向社會發(fā)布。

　　5.起草藥品管理的法律、行政法規(guī)并監(jiān)督實施；依法實施中藥醫(yī).學(xué)教育網(wǎng)搜集整理品種保護制度和藥品行政保護制度。

　　6.起草醫(yī)療器械管理的法律、行政法規(guī)并監(jiān)督實施；負責(zé)醫(yī)療器械產(chǎn)品注冊和監(jiān)督管理；起草有關(guān)國家標準，擬訂和修訂醫(yī)療器械產(chǎn)品行業(yè)標準、生產(chǎn)質(zhì)量管理規(guī)范并監(jiān)督實施。

　　7.注冊藥品，擬訂、修訂和頒布國家藥品標準；擬訂保健品市場準入標準，負責(zé)保健品的審批工作；制定處方藥和非處方藥分類管理制度，建立和完善藥品不良反應(yīng)監(jiān)測制度，負責(zé)藥品再評價、淘汰藥品醫(yī).學(xué)教育網(wǎng)搜集整理的審核和制定國家基本藥物目錄的工作。

　　8.擬訂和修訂藥品研究、生產(chǎn)、流通、使用方面的質(zhì)量管理規(guī)范并監(jiān)督實施。

　　9.監(jiān)督生產(chǎn)、經(jīng)營企業(yè)和醫(yī)療機構(gòu)的藥品、醫(yī)療器械質(zhì)量，定期發(fā)布國家藥品、醫(yī)療器械質(zhì)量公報；依法查處制售假劣藥品、醫(yī)療器械等違法行為。

　　10.依法監(jiān)管放射性藥品、麻醉藥品、醫(yī)療用毒性藥品、精神藥品及特種藥械。

　　11.擬訂和完善執(zhí)業(yè)藥師資格準入制度，監(jiān)督和指導(dǎo)執(zhí)業(yè)藥師注冊工作。

　　12.指導(dǎo)全國藥品監(jiān)督管理和食品、保健品、化妝品安全管理的綜合監(jiān)督工作。

　　13.開展藥品監(jiān)督管理和食品、保健品、化妝品安全管理有關(guān)的政府間、國際組織間的交流與合作。

　　14.承辦國務(wù)院交辦的其他事項。

　　同時，省級藥品監(jiān)督管理部門為省級人民政府的綜合監(jiān)督食品、保健品、化妝品安全管理和主管藥品監(jiān)督管理的直屬機構(gòu)，它的職能由省級人民政府根據(jù)國務(wù)院的改革方案，在國家食品藥品監(jiān)督管理局的指導(dǎo)下，結(jié)合本省的實際情況制定，在轄區(qū)內(nèi)實施藥品的監(jiān)督管理工作和其他相關(guān)的工作。