1998年，根據國務院機構調整的部署，國家對藥品行業(yè)管理的職能進行了調整，在國家經濟貿易委員會下設醫(yī)藥司，履行政府對醫(yī)藥行業(yè)管理的職能。將原國家醫(yī)藥管理局、國家中醫(yī)藥管理局、國內貿易部藥品生產經營行業(yè)管理的職能移交給國家經貿委醫(yī)藥司。

　　除中央部委設立專門機構進行藥品的行業(yè)管理外，在省、地（市）、縣經濟貿易委員會下也設立了醫(yī)藥醫(yī)`學教育網搜集整理管理辦公室，負責轄區(qū)內醫(yī)藥行業(yè)的管理工作。