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蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu):
蛋白質(zhì)分子的二級結(jié)構(gòu)是指多肽鏈骨架中原子的局部空間排列,并不涉及側(cè)鏈的構(gòu)象。在所有已測定的蛋白質(zhì)中均有二級結(jié)構(gòu)的存在,主要形式包括(α-螺旋、β-折疊、β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲。
1.α-螺旋結(jié)構(gòu)
1951年,PAUlinG和Corey根據(jù)多肽鏈骨架中剛性平面及其他可以旋轉(zhuǎn)的原子提出多肽構(gòu)象是螺旋結(jié)構(gòu),他們稱之為α-螺旋,其特點(diǎn)如下:
(1)多肽鏈主鏈圍繞中心軸有規(guī)律地螺旋式上升醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)整理,每隔3.6個氨基酸殘基螺旋上升一圈,每個氨基酸殘基向上平移0.15nm,故螺距為0.54nm.
(2)第一個肽平面羰基上的氧與第四個肽平面亞氨基上的氫形成氫鍵,氫鍵的方向與螺旋長軸基本平行。氫鍵是一種很弱的次級鍵,但由于主鏈上所有肽鍵都參與氫鍵的形成,所以α-螺旋很穩(wěn)定。組成人體蛋白質(zhì)的氨基酸都是L-α-氨基酸,故形成右手螺旋。側(cè)鏈R基團(tuán)伸向螺旋外側(cè)。
2.β-折疊結(jié)構(gòu)
β-折疊與α-螺旋的形狀截然不同,所形成的鋸齒狀結(jié)構(gòu),一般比較短,只含5~8個氨基酸殘基,但兩條以上肽鏈或一條肽鏈內(nèi)的若干肽段的鋸齒狀結(jié)構(gòu)可平行排列,兩條肽鏈走向可相間,也可相反。其特點(diǎn)如下:
(1)多肽鏈伸展,各肽鍵之間折疊成鋸齒狀,R基團(tuán)位于鋸齒狀結(jié)構(gòu)上下方。
(2)肽鏈(段)之間平行排列,肽鏈羰基上的O與亞氨基上的H形成氫鍵,氫鍵的方向與長軸垂直。
(3)若兩條肽鏈走向相同,均從N端指向C端醫(yī)學(xué)|教育網(wǎng)整理,稱順平行折疊,兩殘基間距0.65nm.反之,兩條肽鏈走向相反,一條從N端指向C端,另一條從C端指向N端,稱反平行折疊,兩殘基間距為0.70nm.反平行折疊較順平行折疊更為穩(wěn)定。
3.β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)
包括β-轉(zhuǎn)角和無規(guī)卷曲。β-轉(zhuǎn)角常發(fā)生于肽鏈進(jìn)行180°回折時的轉(zhuǎn)角上。轉(zhuǎn)角通常由4個氨基酸殘基組成,其第一個殘基的羰基氧(O)與第四個殘基的氨基氫(H)可形成氫鍵。轉(zhuǎn)角的第二個殘基常為脯氨酸。無規(guī)卷曲是用來闡述沒有確定規(guī)律性的那部分肽鏈結(jié)構(gòu)。
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