腫瘤組織的蛋白質合成及分解代謝都增強，但合成代謝超過分解代謝，甚至可奪取正常組織的蛋白質分解產物，醫(yī)學教育|網搜集合成腫瘤本身所需要的蛋白質，結果可使機體處于嚴重消耗的惡病質（cachexia）狀態(tài)。腫瘤的分解代謝表現(xiàn)為蛋白質分解為氨基酸的過程增強，而氨基酸的分解代謝則減弱，可使氨基酸重新用于蛋白質合成。這可能與腫瘤生長旺盛有關。腫瘤組織還可以合成腫瘤蛋白，作為腫瘤特異抗原或腫瘤相關抗原，引起機體的免疫反應。有的腫瘤蛋白與胚胎組織有共同的抗原性，亦稱為腫瘤胚胎性抗原。例如肝細胞癌能合成胎兒肝細胞所產生的甲種胎兒蛋白（AFP），此外，卵巢、睪丸含有卵黃囊結構的生殖細胞腫瘤患者血中AFP也有升高；內胚層組織發(fā)生的一些惡性腫瘤如結腸瘤、直腸癌等可產生癌胚抗原（CEA）；胃癌可產生胎兒硫糖蛋白等。雖然這些抗原并無腫瘤特異性，也不是腫瘤所專有，但檢查這些抗原，并結合其他改變可幫助診斷相應的腫瘤和判斷治療后有無復發(fā)。