大多數(shù)微生物屬于這種營(yíng)養(yǎng)類(lèi)型。它們以有機(jī)碳化合物作為碳源和能源。如果微生物的食物是來(lái)自死亡或腐爛的動(dòng)植物尸體，醫(yī)學(xué)教育|網(wǎng)搜集就稱(chēng)其為腐生微生物。如果其生長(zhǎng)必須從活細(xì)胞或組織中獲得營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的，則稱(chēng)之為寄生微生物，例如病毒、衣原體、立克次氏體等。有些微生物是腐生、寄生兼而有之，例如結(jié)核桿菌就是一種以腐生為主，兼營(yíng)寄生的細(xì)菌。