DNA的合成-臨床鄉(xiāng)鎮(zhèn)助理醫(yī)師復(fù)習(xí):
一、DNA生物合成的概念
DNA分子在生物體內(nèi)通過酶促聚合反應(yīng)合成,即DNA的生物合成,DNA的生物合成有DNA指導(dǎo)的DNA合成、RNA指導(dǎo)的DNA合成以及修復(fù)合成三種方式。DNA指導(dǎo)的DNA合成是以DNA為模板,合成新的、與親代模板完全一樣的DNA分子,故稱這種DNA合成為DNA的復(fù)制,它是細(xì)胞內(nèi)DNA合成的最主要方式;RNA指導(dǎo)的DNA合成是以RNA為模板,合成與RNA核苷酸序列一致的DNA分子,因其過程與遺傳信息流動時的轉(zhuǎn)錄過程方向相反。故稱反轉(zhuǎn)錄合成;反轉(zhuǎn)錄作用廣泛存在于生物界,在RNA病毒感染宿主的致病過程有重要意義,某些物理、化學(xué)或生物學(xué)(病毒)因素可導(dǎo)致DNA分子的損傷,生物體細(xì)胞內(nèi)存在DNA修復(fù)合成體系,可使損傷的DNA分子得以修復(fù)。
二、DNA的復(fù)制合成
(一)復(fù)制的概念 DNA合成進行時,以兩條親代DNA鏈中的每一條鏈為模板,在DNA依賴的DNA聚合酶催化下,按A與T、C與C堿基配對原則合成子代DNA的過程稱DNA的復(fù)制。由于復(fù)制合成的子代DNA兩條脫氧核糖核苷酸鏈中有一條來自親代DNA,另一條是以前者為模板新合成的子代DNA鏈,所以DNA的這種合成作用又稱半保留復(fù)制。
(二)DNA復(fù)制過程真核生物的DNA復(fù)制過程與原核基本相似醫(yī)|學(xué)教育網(wǎng)搜集整理,有些機制尚不十分清楚。根據(jù)目前認(rèn)識,可將E.coli DNA復(fù)制過程(圖2-10-1)分為以下階段。
1.螺旋的松弛與解鏈 在復(fù)制起始點ori所在部位首先由DNA拓?fù)洚悩?gòu)酶(Topo)和解鏈酶松馳DNA超螺旋結(jié)構(gòu),解開一段雙鏈,并由單鏈DNA結(jié)合蛋白(SSB)保護和穩(wěn)定 DNA單鏈。形成復(fù)制點,這個復(fù)制點的形狀像一個叉子,即復(fù)制叉,將模板展示出來。
2.引物RNA的合成 當(dāng)兩股單鏈暴露出足夠數(shù)量的堿基對時,DNA復(fù)制即進入引發(fā)階段,主要由引發(fā)酶和引發(fā)前體參與合成RNA引物。以3‘-5’走向的親代DNA鏈為模板進行合成的子鏈,稱前導(dǎo)鏈;以5‘-3’走向的親代DNA鏈為模板進行合成的子鏈,稱隨從鏈。前導(dǎo)鏈的引發(fā)較簡單,在引發(fā)酶催化下合成一個短的RNA引物(10-60 nt),繼而從RNA引物的3‘末端開始連續(xù)地沿著5’-3‘方向進行DNA鏈的合成。隨從鏈引物的合成則是在引發(fā)酶和引發(fā)前體,以及DnaA蛋白聯(lián)合作用下臺成的。繼而在引物的3’-OH端進行岡崎片段的合成。
3.DNA鏈的延長 DNA鏈的延長是在DNA聚合酶(DNA pol)催化下,以四種三磷酸脫氧核苷(dNTP)即dATP、dGTP、dCTP和dTTP為原料進行的聚合反應(yīng)。反應(yīng)體系中有DNA模板、引物及Mg2+存在。聚合作用是自引物的3‘-OH端上開始,從5’—3‘方向逐個加入脫氧核苷酸dNMP而脫下焦磷酸PPi,使DNA鏈得以延長。復(fù)制時DNA的兩條鏈均可作為模板,分別合成兩條子代DNA鏈。由于DNA的兩條鏈?zhǔn)欠雌叫械?,即一條鏈走向是5’-3‘而另一條鏈?zhǔn)?’-5‘走向,但是DNA poI催化DNA鏈的合成只能沿著5’-3‘方向進行,因此解開雙鏈后在3’-5‘走向的模板上可以順利地按5’-3‘方向合成新的DNA鏈,即前導(dǎo)鏈;而以5’-3‘走向鏈為模板、仍然按5’-3‘方向合成只能是不連續(xù)的短DNA片段(岡崎片段)。
4.終止 DNA片段合成至一定長度后,鏈中的RNA引物即被核酸酶水解而切掉。此時出現(xiàn)的缺口由DNA的繼續(xù)延長而填補,然后由DNA連接酶將這些片段再連接起來,形成完整的DNA鏈。E.coli DNA的復(fù)制叉復(fù)制過程如簡圖2—10—l.
DNA復(fù)制完畢后,DNA Topo將DNA分子引入超螺旋結(jié)構(gòu),進行進一步的裝配。真核生物DNA的復(fù)制與E.coli基本相似,但是還有一些特點,如真核生物復(fù)制速度約為50 nt/s(E.coli為500nt/s),其ori位點有多個,岡崎片段的長度小于原核生物,DNA聚合酶也不同等。