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鼠疫耶爾森菌簡稱鼠疫桿菌，屬腸桿菌科，耶爾森菌屬。新分離株以美蘭或姬姆薩染色，為兩端鈍圓、兩極濃染、橢圓形革蘭氏陰性小桿菌，無鞭毛，無芽抱，有英膜，兼性需氧。在普通培養(yǎng)基上生長良好但緩慢，在陳舊培養(yǎng)基及化膚病灶中呈多型性。培養(yǎng)最適宜溫度28～30℃，最適宜pH值為6.9-7.1.

本菌菌體含有內毒素，并能產(chǎn)生鼠毒素和一些有致病作用的抗原成分。己證實有18種抗原，即A-K、N、O、Q、R、S、T及W（VW），其中F、T及VW為最主要抗原，為病原菌的特異性抗原。F為莢膜抗原，有高度免疫原性及特異性，檢測其中的F1可用于本病的血清學診斷，其抗體有保護作用。V和W抗原為菌體表面抗原，為本菌的毒力因子，與細菌的侵襲力有關。T抗原即鼠毒素，存在于細胞內，引起局部壞死和毒血癥，有良好的抗原性，人和動物感染后可產(chǎn)生抗毒素抗體。內毒素可引中毒癥狀和病理變化，為本菌致病致死的毒性物質。

本菌對外界抵抗力較弱，對干燥、熱和一般消毒劑均甚敏感。陽光直射、100℃1分鐘可致細菌死亡。耐低溫，在冰凍組織或尸體內可存活數(shù)月至數(shù)年，在膿液、痰、蚤類和土壤中可存活1年以上。