主要有以下四種方法：

　　按臟腑辨證配穴

　　就是根據中醫(yī)的傳統理論來選穴組成處方。如中醫(yī)學認為“肺主皮毛”，故可取肺穴治療皮膚??；腎，“其華在發(fā)”，故可取腎穴治療斑禿等。

　　按現代醫(yī)學理論配穴

　　耳穴中有不少是按現代醫(yī)學的名稱命名的，如皮質下、交感、腎上腺、內分泌、耳迷根等。這些穴位的功能和現代醫(yī)學所說的基本一致，如腎上腺穴，有近似調節(jié)腎上腺的功能，故可按現代醫(yī)學理論配穴。

　　按相應部位配穴

　　此法最為簡單，臨床上用得也最廣泛。即醫(yī)學教育|網搜集整理根據病變所在，在耳郭對應的部位取穴配方。如肩周炎取肩穴，胃炎取胃穴等。

　　按臨床經驗配穴

　　指對臨床中發(fā)現，對某一或某些病癥有獨特作用的穴位進行組方。如耳尖穴治高血壓、耳中穴治隔肌痙攣等。

　　在實際治療中，上面各種配穴常綜合運用，如高血壓，可據西醫(yī)理論取交感，按臟腑學說加心，據臨床經驗加耳尖等。